El Área de Derechos Sexuales y Reproductivos, como parte de sus propósitos, tiene la defensa activa de los derechos sexuales y reproductivos. Desde aquí, la participación que ha tenido en diversos litigios. A continuación se mencionan algunos de ellos, en orden cronológico:

Amparo colectivo sin número: "Derecho a decidir". 
Este amparo directo colectivo fue promovido en contra de los artículos 128 del Código Penal del Estado de San Luis Potosí y 258 del Código de Procedimientos Penales del Estado de San Luis Potosí, con base en los cuales una pareja fue acusada y encarcelada por haber cometido el delito de aborto. Si bien no llegó a ser discutido en la Suprema Corte, este caso reviste fundamental importancia por ser la primera articulación del derecho a decidir que el Área ha realizado en el ámbito litigioso. 
 
Amicus Curiae sobre el derecho a la información

El Área presentó un Amicus Curiae ante la Corte Constitucional de Colombia para el asunto de la acción de tutela interpuesta por Women's Link –y 1,201 mujeres colombianas– en contra de diversos funcionarios del Estado Colombiano por considerar que difundieron información tergiversada y no confiable sobre el ejercicio de diversos derechos sexuales y reproductivos.

Comunicado de prensa de Women's Link sobre la acción de tutela
La acción de tutela interpuesta por Women's Link
Amicus Curiae para la Acción de Tutela 3.331.859

Amicus Curiae para el caso de Karen Atala e hijas
El Área presentó un Amicus Curiae para el caso de Karen Atala e hijas v. Chile, resuelto por la Corte Interamericana de Derechos Humanos en febrero de 2012. Fue el primer asunto que resolvió esta Corte en materia de diversidad sexual y familiar y lo hizo de manera favorable para el ejercicio de los derechos de la comunidad LGTB.

Amicus Curiae para Karen Atala e hijas v. Chile
Resolución de la Corte Interamericana de Derechos Humanos

Acción de inconstitucionalidad 2/2010
El Área, junto con la Clínica de Interés Público del CIDE, representó a la Asamblea Legislativa del Distrito Federal en la Acción de Inconstitucionalidad 2/2010, resuelta por la Suprema Corte de Justicia de la Nación en agosto de 2010. El caso fue popularmente conocido como el del matrimonio entre personas del mismo sexo.

Informe que presentó la Asamblea Legislativa del Distrito Federal
Resolución de la Suprema Corte

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